Nos Países Baixos, não há nenhuma disputa sobre a natureza e o estatuto religioso da Igreja de Scientology por parte do governo. Ao longo dos anos, tanto o Poder Executivo como os tribunais têm publicado numerosos reconhecimentos de Scientology como uma religião e da Igreja de Scientology como uma organização religiosa que presta serviços religiosos aos seus paroquianos. A Igreja de Scientology está registada como uma organização religiosa e a Igreja de Scientology foi incorporada como uma entidade jurídica.
Os ministérios do Governo dos Países Baixos expressam o seu reconhecimento da religião de Scientology pelo seu tratamento da Igreja, dos seus paroquianos e dos seus ministros. Por exemplo, o Departamento da Justiça concede aos ministros de Scientology o direito de visitar prisões para aconselhar e ministrar os reclusos, o Departamento da Educação concede aos Scientologists o direito de formar as suas próprias escolas para educarem os seus filhos de acordo com as suas convicções religiosas e a Administração Fiscal aceita o estatuto de Scientology como uma religião.
Em 2007, uma paroquiana de Scientology solicitou com sucesso ao tribunal para que a sua filha recebesse o seu estudo em casa com base nas suas, e da sua filha, crenças religiosas. O tribunal contou com a decisão do Tribunal Europeu dos Direitos do Homem em Igreja de Scientology vs. Moscovo (5 de abril de 2007, Appl. 18147/02) para chegar a esta decisão. Em 1991, de acordo com os princípios da igualdade religiosa e da não discriminação, um inspetor das finanças foi instruído pelos seus superiores para tratar a declaração fiscal de um ministro de Scientology da mesma forma que as declarações do clero de outras religiões.
